उदित प्रकाश राय पर अपनी पोस्टिंग की विभिन्न अवधियों के दौरान अपनी अप्रेजल परफॉर्मेंस एनुअल रिपोर्ट्स (APAR- Annual Performance Appraisal Reports) पर दिल्ली और अंडमान और निकोबार प्रशासन के मुख्य सचिवों के कथित रूप से जाली हस्ताक्षर करने का आरोप है. राय पर 2017 से 2021 के बीच अपनी अप्रेजल परफॉर्मेंस एनुअल रिपोर्ट्स (एपीएआर) में दो मुख्य सचिवों के जाली हस्ताक्षर करने का आरोप है.
उपराज्यपाल ने आगे की कार्रवाई के लिए मामला गृह मंत्रालय को भेजने की सिफारिश की है. आईपी एस्टेट पुलिस स्टेशन में राय के खिलाफ आईपीसी की धारा 465/471 के तहत जालसाजी का आपराधिक मामला दर्ज किया गया है.
राय वर्तमान में भ्रष्टाचार के एक अन्य मामले में निलंबित हैं, जिसमें उन पर दिल्ली कृषि विपणन बोर्ड के उपाध्यक्ष पद पर रहते हुए एक इंजीनियर से रिश्वत लेने का भी आरोप है. राय जब दिल्ली जल बोर्ड के सीईओ के रूप में कार्यरत थे, तब उन पर दिल्ली के जल विहार में अपने 5 करोड़ रुपये के आधिकारिक आवास के निर्माण के लिए एक हेरीटेज स्ट्रक्चर को ध्वस्त करने का भी आरोप लगा था.
